３.提供生物技術(shù)時(shí)附帶提供的微生物菌種母本和動(dòng)、植物新品種，應(yīng)包括在免征營(yíng)業(yè)稅的營(yíng)業(yè)額內(nèi)。但批量銷售的微生物菌種，應(yīng)當(dāng)征收增值稅。
     （三）免稅的審批程序
     １.納稅人從事技術(shù)轉(zhuǎn)讓、開(kāi)發(fā)業(yè)務(wù)申請(qǐng)免征營(yíng)業(yè)稅時(shí)，須持技術(shù)轉(zhuǎn)讓、開(kāi)發(fā)的書面合同，到納稅人所在地省級(jí)科技主管部門進(jìn)行認(rèn)定，再持有關(guān)的書面合同和科技主管部門審核意見(jiàn)證明報(bào)當(dāng)?shù)厥〖?jí)主管稅務(wù)機(jī)關(guān)審核。
     外國(guó)企業(yè)和外籍個(gè)人從境外向中國(guó)境內(nèi)轉(zhuǎn)讓技術(shù)需要免征營(yíng)業(yè)稅的，需提供技術(shù)轉(zhuǎn)讓或技術(shù)開(kāi)發(fā)書面合同、納稅人或其授權(quán)人書面申請(qǐng)以及技術(shù)受讓方所在地的省級(jí)科技主管部門審核意見(jiàn)證明，經(jīng)省級(jí)稅務(wù)主管機(jī)關(guān)審核后，層報(bào)國(guó)家稅務(wù)總局批準(zhǔn)。①
     ２.在科技和稅務(wù)部門審核批準(zhǔn)以前，納稅人應(yīng)當(dāng)先按有關(guān)規(guī)定繳納營(yíng)業(yè)稅，待科技、稅務(wù)部門審核后，再?gòu)囊院髴?yīng)納的營(yíng)業(yè)稅款中抵交，如以后一年內(nèi)未發(fā)生應(yīng)納營(yíng)業(yè)稅的行為，或其應(yīng)納稅款不足以抵頂免稅額的，納稅人可向負(fù)責(zé)征收的稅務(wù)機(jī)關(guān)申請(qǐng)辦理退稅。②
     三、關(guān)于所得稅
     （一）對(duì)社會(huì)力量，包括企業(yè)單位（不含外商投資企業(yè)和外國(guó)企業(yè)）、事業(yè)單位、社會(huì)團(tuán)體、個(gè)人和個(gè)體工商戶（下同），資助非關(guān)聯(lián)的科研機(jī)構(gòu)和高等學(xué)校研究開(kāi)發(fā)新產(chǎn)品、新技術(shù)、新工藝所發(fā)生的研究開(kāi)發(fā)經(jīng)費(fèi)，經(jīng)主管稅務(wù)機(jī)關(guān)審核確定，其資助支出可以全額在當(dāng)年度應(yīng)納稅所得額中扣除。當(dāng)年度應(yīng)納稅所得額不足抵扣的，不得結(jié)轉(zhuǎn)抵扣。
     非關(guān)聯(lián)的科研機(jī)構(gòu)和高等學(xué)校是指，不是資助企業(yè)所屬或投資的，并且其科研成果不是唯一提供給資助企業(yè)的科研機(jī)構(gòu)和高等學(xué)校。
     企業(yè)向所屬的科研機(jī)構(gòu)和高等學(xué)校提供的研究開(kāi)發(fā)經(jīng)費(fèi)資助支出，不實(shí)行抵扣應(yīng)納稅所得額辦法。
     企業(yè)等社會(huì)力量向科研機(jī)構(gòu)和高等學(xué)校資助研究開(kāi)發(fā)經(jīng)費(fèi)，申請(qǐng)抵扣應(yīng)納稅所得額時(shí)，須提供科研機(jī)構(gòu)和高等學(xué)校開(kāi)具的研究開(kāi)發(fā)項(xiàng)目計(jì)劃、資金收款證明及其他稅務(wù)機(jī)關(guān)要求提供的相關(guān)資料，不能提供相關(guān)資料的，稅務(wù)機(jī)關(guān)可不予受理。
     （二）軟件開(kāi)發(fā)企業(yè)實(shí)際發(fā)放的工資總額，在計(jì)算應(yīng)納稅所得額時(shí)準(zhǔn)予扣除。
     四、關(guān)于外商投資企業(yè)和外國(guó)企業(yè)所得稅
     外商投資企業(yè)和外國(guó)企業(yè)資助非關(guān)聯(lián)科研機(jī)構(gòu)和高等學(xué)校研究開(kāi)發(fā)經(jīng)費(fèi)，參照《中華人民共和國(guó)外商投資企業(yè)和外國(guó)企業(yè)所得稅法》中有關(guān)捐贈(zèng)的稅務(wù)處理辦法，可以在資助企業(yè)計(jì)算企業(yè)應(yīng)納稅所得稅額時(shí)全額扣除。
     五、關(guān)于進(jìn)出口稅收
     （一）對(duì)企業(yè)（包括外商投資企業(yè)、外國(guó)企業(yè)）為生產(chǎn)《國(guó)家高新技術(shù)產(chǎn)品目錄》的產(chǎn)品而進(jìn)口所需的自用設(shè)備及按照合同隨設(shè)備進(jìn)口的技術(shù)及配套件、備件。除按照國(guó)發(fā)［１９９７］３７號(hào)文件規(guī)定《國(guó)內(nèi)投資項(xiàng)目不予免稅的進(jìn)口商品目錄》所列商品外，免征關(guān)稅和進(jìn)口環(huán)節(jié)增值稅。
     （二）對(duì)企業(yè)（包括外商投資企業(yè)、外國(guó)企業(yè)）引進(jìn)屬于《國(guó)家高新技術(shù)產(chǎn)品目錄》所列的先進(jìn)技術(shù)，按合同規(guī)定向境外支付的軟件費(fèi)，免征關(guān)稅和進(jìn)口環(huán)節(jié)增值稅。
     軟件費(fèi)是指進(jìn)口貨物的納稅義務(wù)人為在境內(nèi)制造、使用、出版、發(fā)行或者播映該項(xiàng)貨物的技術(shù)和內(nèi)容，向境外賣方支付的專利費(fèi)、商標(biāo)費(fèi)以及專有技術(shù)、計(jì)算機(jī)軟件和資料等費(fèi)用。
     （三）對(duì)列入科技部、外經(jīng)貿(mào)部《中國(guó)高新技術(shù)商品出口目錄》的產(chǎn)品，凡出口退稅率未達(dá)到征稅率的，經(jīng)國(guó)家稅務(wù)總局核準(zhǔn)，產(chǎn)品出口后，可按征稅率及現(xiàn)行出口退稅管理規(guī)定辦理退稅。
     六、科研機(jī)構(gòu)轉(zhuǎn)制問(wèn)題
     （一）中央直屬科研機(jī)構(gòu)以及省、地（市）所屬的科研機(jī)構(gòu)轉(zhuǎn)制后，自1999年至2003年5年內(nèi)，免征企業(yè)所得稅和科研開(kāi)發(fā)自用土地的城鎮(zhèn)土地使用稅。
     本條所指科研機(jī)構(gòu)不包括：已經(jīng)轉(zhuǎn)制和已并入企業(yè)的科研機(jī)構(gòu)，以及所有從事社會(huì)科學(xué)研究
    的科研機(jī)構(gòu)。
     （二）享受上述稅收優(yōu)惠政策的科研機(jī)構(gòu)，需持轉(zhuǎn)制變更后的企業(yè)工商登記材料報(bào)當(dāng)?shù)刂鞴芏悇?wù)機(jī)關(guān)，并按規(guī)定辦理有關(guān)減免稅手續(xù)。