一、創(chuàng)業(yè)投資機構(gòu)資格申請：創(chuàng)業(yè)投資機構(gòu)根據(jù)引導(dǎo)基金資格申請要求準備申請材料，經(jīng)省級科技主管部門推薦后，報送創(chuàng)新基金管理中心。創(chuàng)新基金管理中心組織專家根據(jù)《暫行辦法》所規(guī)定的條件，對創(chuàng)業(yè)投資機構(gòu)的資格申報材料進行審核篩選，符合條件的創(chuàng)業(yè)投資機構(gòu)可以申報2009年引導(dǎo)基金的各類項目（2007、2008年已通過引導(dǎo)基金資格審查的創(chuàng)業(yè)投資機構(gòu)可以直接申請2009年引導(dǎo)基金項目）。
二、階段參股項目的申報評審程序由申報材料受理、盡職調(diào)查、評審委員會評審、項目審定四個步驟組成。
1、申報材料受理：創(chuàng)業(yè)投資機構(gòu)按要求準備申請材料，經(jīng)省級科技、財政主管部門推薦備案后，報送創(chuàng)新基金管理中心。創(chuàng)新基金管理中心對申報材料完備性、規(guī)范性和有效性等進行形式審查。
2、盡職調(diào)查：創(chuàng)新基金管理中心組織科技、金融等領(lǐng)域的專業(yè)人員對創(chuàng)業(yè)投資機構(gòu)做盡職調(diào)查，必要時也可委托會計師事務(wù)所、律師事務(wù)所等專業(yè)中介機構(gòu)對創(chuàng)業(yè)投資機構(gòu)進行財務(wù)審計和相關(guān)法律調(diào)查。根據(jù)盡職調(diào)查結(jié)果，創(chuàng)新基金管理中心向評審委員會提出評審項目名單。
3、 評審委員會評審：專家根據(jù)相關(guān)評審標準，對參股方案和盡職調(diào)查結(jié)果提出初步評價和建議；根據(jù)評審委員會建議，創(chuàng)新基金管理中心補充盡職調(diào)查或會同創(chuàng)業(yè)投資機構(gòu)進一步完善參股方案及相關(guān)協(xié)議；專家與創(chuàng)業(yè)投資機構(gòu)的代表面談；專家在充分討論的基礎(chǔ)上對最終參股方案進行評分并提出立項意見。
4、 項目審定：創(chuàng)新基金管理中心根據(jù)評審委員會專家的評審結(jié)果提出階段參股項目的立項建議，報科技部、財政部審定后在創(chuàng)新基金網(wǎng)站上公示，如兩周內(nèi)無異議，與有關(guān)創(chuàng)業(yè)投資機構(gòu)及其它投資方簽署相關(guān)法律文本。
三、風險補助、投資保障項目的申報評審程序由申報材料受理、項目評審和項目審定三個步驟組成。
1、申報材料受理：創(chuàng)業(yè)投資機構(gòu)按要求準備申請材料，經(jīng)省級科技、財政主管部門初審?fù)扑]后，報送創(chuàng)新基金管理中心。創(chuàng)新基金管理中心對申報材料的完備性、有效性等進行形式審查。
2、項目評審：由創(chuàng)新基金管理中心組織專家評審對創(chuàng)業(yè)投資機構(gòu)申報的項目進行評審，并提出初步立項建議。
3、項目審定：創(chuàng)新基金管理中心根據(jù)專家評審結(jié)果提出風險補助、投資保障項目的立項建議，報科技部、財政部審定后，在創(chuàng)新基金網(wǎng)站上公示，如兩周內(nèi)無異議，與創(chuàng)業(yè)投資機構(gòu)等簽署相關(guān)合同。
四、跟進投資項目申報評審程序另行通知。